Виктор Евгеньевич Прокопенко родился в 24 октября 1944 года в городе Мариуполе Донецкой области, где и начал карьеру футболиста. Выступал за команду завода имени Ильича (1961), команду группы советских войск в Германии (1964 - сентябрь 1967), «Локомотив» (Винница, октябрь 1967 - 1968), «Черноморец» (Одесса, 1969 - 1970, 1974 - 1975), «Шахтер» (Донецк, 1971 - 1973), «Локомотив» (Херсон, 1976).
Бронзовый призер чемпионата СССР 1974 года. Выступал за олимпийскую сборную СССР. В высшей лиге чемпионата СССР провел 85 матчей и забил 13 голов (1969-1971, 1974-1975).
Тренерскую карьеру Виктор Прокопенко начал в Одессе в 1977 году войдя в тренерский штаб «Черноморца».
К сезону 1982 года Прокопенко готовил команду уже в должности главного тренера.
Виктор Прокопенко работал главным тренером «Черноморца» (1982 - 1986, 1989 - май 1994), главным тренером «Ротора» (1987 - 1988, июнь 1994 — 1999), главным тренером донецкого «Шахтера» (ноябрь 1999 — 2001), вице-президентом «Шахтера» (октябрь 2001 — апрель 2002), главным тренером московского «Динамо» (апрель 2002 — 2003), спортивным директором «Шахтера» (2004 — март 2006). Был первым тренером национальной сборной Украины (1992).
Под руководством Прокопенко «Ротор» становился серебряным призером чемпионата России 1997-го и бронзовым призером 1996 года, «Черноморец» становился обладателем Кубка Украины 1992 и 1994 годов, бронзовым призером первенства 1993 и 1994 годов., «Шахтер» завоевывал серебряные медали в 2000 и 2001 годах, выиграл Кубок в 2001-м, пробился в групповой этап Лиги чемпионов в 2000 году.
В 2006 году Виктор Прокопенко избран депутатом Верховной Рады Украины.
«Я поговорил с президентом ФК »Шахтер« Ринатом Ахметовым, он предложил... После этого я решил сам сделать такой шаг. Посмотрим, что из этого получится. Для меня немаловажно мнение моих близких, родственников, друзей, сослуживцев, одноклубников. Но, как правило, я руководствуюсь всегда своими чувствами, сердцем, умом, опытом. Это — решающее», — рассказал Прокопенко вскоре после избрания депутатом Верховной Рады.
У депутата Прокопенко много раз спрашивали, не скучает ли он по футболу и не собирается ли вернуться к тренерской деятельности. «Как вам сказать, футбол - это болезнь на всю жизнь, в хорошем понимании этого слова. Конечно, скучаю. Знаете, в фильме »Таинственный монах« была замечательная фраза: »Путь наш во мраке«. Так вот, все в нашей жизни может быть, посмотрим», — сказал Виктор Прокопенко в одном из интервью.
Вернуться в футбол Виктор Евгеньевич не успел — в субботу, 18 августа 2007 года он скоропостижно скончался в Одессе. Прокопенко внезапно стало плохо, и оперативно прибывшие медики оказались бессильны. Предварительная причина смерти — тромб.
«Газета.Ru» выражает соболезнования родным и близким Виктора Евгеньевича Прокопенко.