Осенью 1991 года в условиях начавшегося распада СССР руководство Чеченской Республики заявило о выходе республики из состава СССР и РСФСР и о государственном суверенитете.
В сентябре вооруженные боевики под руководством бывшего генерала советских ВВС Джохара Дудаева захватили административные здания, радио- и телецентр. По сути, произошел государственный переворот, и по итогам выборов 27 октября Дудаев стал первым президентом и верховным главнокомандующим Чеченской Республики Ичкерия.
С этого момента Чечня стала фактически независимой от Москвы территорией. В течение нескольких месяцев чеченские вооруженные формирования захватили оружие из расположенных в республике складов Минобороны.
В декабре 1994 года правительство приняло постановление о разоружении вооруженных формирований силовыми методами, а 31 декабря федеральные войска начали штурм Грозного, в результате которого город был почти полностью разрушен. Первая чеченская война, официально – восстановление конституционного порядка в Чеченской Республике, продлилась с 11 декабря 1994 по 31 августа 1996 года. Погибли несколько десятков тысяч мирных жителей, не менее 4 тыс. российских военнослужащих.
Чеченский конфликт привел к волне терактов по всей России: захват заложников в Будённовске, теракты в Кизляре и Первомайском. Требования боевиков, как правило, сводились к признанию независимости Ичкерии и выводу федеральных войск из республики.
6 августа 1996 года федеральные войска оставили Грозный после тяжелых оборонительных боев, понеся большие потери. 31 августа 1996 года были подписаны Хасавюртские соглашения о прекращении боевых действий. Итогами первой кампании стали вывод российских войск, массовые разрушения и жертвы и фактически независимость Чечни до второй чеченской войны, которая длилась с 1999 по 2009 год.
С 4 по 16 сентября 1999 года по России прошла новая серия терактов – в дагестанском Буйнакске, в Волгодонске, в Ростовской области и в Москве взрывали жилые дома. После этого 30 сентября 1999 года федеральные войска снова вошли в Чечню. За несколько месяцев «контртеррористической операции» армии удалось установить контроль над большей частью республики и, по сути, ликвидировать независимую Ичкерию. Однако теракты в России продолжались. Так, в 2002 году боевики захватили заложников в Москве в Театральном центре на Дубровке, в 2004 году произошел захват заложников в бесланской школе №1 в Северной Осетии.