Люди, переселившиеся в города, потеряли 57 из 100 или около того ветвей филогенетического дерева кишечного микробиома, присутствовавшего у их предков и в настоящее время обнаруживающегося у шимпанзе и бонобо. Такое сообщение сделал Эндрю Мёллер, биолог-эволюционист из Корнеллского университета, на Ежегодном собрании Американского общества микробиологии Microbe 2022, сообщает портал Science.org.
Микробиом включает в себя все бактерии, грибки, вирусы, а также другую микроскопическую живность, населяющую любое животное или растение. Где-то глубоко в кишечнике человека мириады «хороших» бактерий и других микроорганизмов помогают переваривать пищу и поддерживать здоровье, воздействуя на иммунную, метаболическую и нервную системы.
Мёллер и его коллеги собрали экскременты нескольких групп африканских шимпанзе и бонобо, затем выделили и секвенировали микробную ДНК в фекалиях, производимых с участием кишечных микробов. Они также обобщили данные о ДНК кишечных микробов, ранее собранные другими исследователями для горилл и других приматов, и проанализировали информацию о 22 нечеловекоподобных обезьянах. Компьютерные программы позволили сравнить фрагменты ДНК секвенированных геномов всех присутствовавших там микроорганизмов с данными о кишечном микробиоме 49 человеческих популяций и древней ДНК из окаменелых человеческих экскрементов. Накладывая все это на генеалогическое древо приматов, удалось изучить изменения взаимоотношений между различными микробными группами у разных приматов и показать, что некоторые специфические кишечные микробы проходили «диверсификацию» по мере того, как эволюционировали вместе со своим хозяином-приматом, в то время как другие попросту исчезли. Довольно много микробов навсегда покинули кишечник человека, так как на них оказывали большое влияние переселение бывших охотников-собирателей в города, использование антибиотиков, увеличение количества самых различных стрессов — и вместе с тем улучшение гигиены. При этом некоторые видные и авторитетные исследователи бьют настоящую тревогу по поводу уменьшения разнообразия микробиома кишечника — это может грозить увеличением заболеваемости астмой и провоцировать разного рода воспалительные процессы. У людей, например, кишечные бактерии ощутимо влияют на то, как именно иммунная система реагирует на патогены и аллергены, к тому же они сложным образом взаимодействуют с мозгом, порой определяя настроение.
Группа Мёллера сумела оценить, когда именно исчезали некоторые кишечные микробы человека. Некоторые из них были потеряны тысячи лет назад, другие исчезли совсем недавно, причем больше всего потерь обнаружилось среди современных горожан. Мёллер и другие ученые полагают, что выявление пропавших микробов может стать первым шагом к их возвращению. «Если мы определим, что эти группы выполняли важные функции для поддержания здоровья людей, то, возможно, мы сможем восстановить их с помощью пробиотиков», — считают исследователи. Впрочем, не все подобные потери обязательно несут негативный характер, возможно, большая часть этих микробов в действительности сейчас как раз и не нужна, считают другие ученые. Тем не менее все согласны с необходимостью дальнейшего изучения все большего количества различных человеческих популяций, чтобы убедиться, что какие-либо сверхполезные микробы не прячутся в кишечниках людей в отдаленных частях мира. Уже предпринимаются усилия по сбору и сохранению микробиомов таких людей, живущих далеко от городов, на случай, если у них действительно присутствуют недостающие микробы.