Корм для рыб сложнее человека

Геном рачка-дафнии содержит больше генов, чем геном человека

Геном рачка-дафнии содержит минимум на пять тысяч больше генов, чем геном человека. Таким образом дафния, о результатах секвенирования генома которой сообщается в журнале Science, стала «модельным» организмом для лабораторных биологических исследований наряду с мышью, дрожжами и мушкой Drosophila.

врез №
skin: article/incut(default)
data:

{
    "_essence": "test",
    "id": "3491606",
    "incutNum": 1,
    "repl": "<1>:{{incut1()}}",
    "uid": "_uid_3514698_i_1"
}

Центральной публикацией нового номера журнала Science стала работа международного коллектива ученых, в которой рассказывается о секвенировании (определении последовательности ДНК, то есть расшифровке) генома крошечного (размером несколько миллиметров) рачка Daphnia pulex (дафния пулекс). Этот рачок, который имеет широкое распространение, в том числе и в России, и хорошо известен всем, кто дома держит аквариум, стал первым представителем ракообразных, чей геном был расшифрован.

По итогам работы ученые получили ряд интересных результатов. Подробнее о ходе исследования, которое объединило 69 ученых из 24 научных учреждений, «Газете.Ru» рассказал один из авторов публикации в Science Игорь Григорьев, сотрудник Национальной лаборатории Беркли, директор программы эукариотических геномов Объединенного геномного института (Joint Genome Institue, JGI, Калифорния, США), где геном пресноводного рачка дафнии был секвенирован. Этот институт в 2004 году успешно завершил проект «Геном человека» и теперь широко применяет разработанные технологии для анализа других геномов.

врез №
skin: article/incut(default)
data:

{
    "_essence": "test",
    "id": "3478674",
    "incutNum": 3,
    "repl": "<3>:{{incut3()}}",
    "uid": "_uid_3514698_i_3"
}

«Геном крошечного рачка дафнии принес много сюрпризов. Дафния обитает в пресноводных водоемах и очень чувствительна к самым незначительным загрязнениям воды, реагируя на них изменениями цвета и формы, — пояснил ученый. — Поэтому этого рачка используют для контроля загрязнений окружающей среды, и его геном позволит лучше понять эти механизмы.

Расшифровав этот сравнительно небольшой геном, мы, к большому удивлению, обнаружили заметно (по меньшей мере на пять тысяч) больше генов, чем в геноме человека!

Наличие большинства этих генов подтверждено экспериментально. Как оказалось, около половины из них — совершенно новые гены, функция которых неизвестна.

врез №
skin: article/incut(default)
data:

{
    "_essence": "test",
    "id": "3341210",
    "incutNum": 2,
    "repl": "<2>:{{incut2()}}",
    "uid": "_uid_3514698_i_2"
}

Однако именно эти гены наиболее бурно реагируют на изменения окружающей среды».

Игорь Григорьев рассказал, что в процессе эволюции дафнии гены многократно удваивались, помогая ей приспосабливаться к изменяющимся условиям обитания: «Примером является большая группа расположенных друг за другом генов белка гемоглобина, переносчика кислорода. Связываясь с кислородом, эти белки придают красноватую окраску прозрачному тельцу рачка.

Таким образом, подобно лакмусовой бумаге, дафния меняет цвет в зависимости от степени загрязнения водоема».

врез №
skin: article/incut(default)
data:

{
    "_essence": "test",
    "id": "3404805",
    "incutNum": 4,
    "repl": "<4>:{{incut4()}}",
    "uid": "_uid_3514698_i_4"
}

Говоря о важности изучения геномов, Игорь Григорьев отметил, что раскодированные геномы зачастую служат импульсом к новым исследованиям. «Несколько лет назад геномом дафнии интересовались Джон Колборн из Университета Индианы (США) и всего лишь несколько ученых-энтузиастов. Сегодня, имея в руках данные генома дафнии, уже сотни групп ученых по всему миру активно исследуют различные его аспекты. Более 50 научных публикаций о дафнии помимо большой статьи в Science описывают эти результаты.

В результате рачок дафния стал «модельным» организмом для лабораторных биологических исследований наряду с мышью, дрожжами и мушкой Drosophila.

Кроме того, расшифрованный геном дафнии дает новый, более точный инструмент в руки экологов для мониторинга водоемов и изменений окружающей среды», — подытожил ученый.