Бактерии, обитающие на нашей планете на несколько миллиардов лет дольше людей, приспособились за это время практически ко всем возможным местам обитания. Горные породы, ядовитые испарения, термальные источники, сверхкислые отложения и даже подледные озера вместо того, чтобы погубить прокариот, нередко становятся для последних не только домом, но и стабильным источником энергии. Наверное, и появление человека, как, впрочем, и других зверей, было воспринято бактериями исключительно положительно – тут тебе и дом, и еда, и даже транспортное средство.
С патогенными и полезными обитателями нашего пищеварительного тракта ученые вроде бы разобрались – доказательством тому широкий спектр соответственно анти- и эубиотиков на прилавках аптек. А вот жители кожи до недавнего времени практически оставались без внимания. Юлия Шегре из Национального института изучения генома человека в Бетесде и её коллеги
составили бактериальную карту поверхности человеческого тела, в которую попали 205 видов, постоянно обитающих на нашей коже.
Сказать, что этой проблемой совсем не занимались раньше, было бы несправедливо. Как и в кишечнике, на коже постоянно обитают симбиотические бактерии, обеспечивающие известную кислотность 5,5, есть и преходящие виды, передающиеся с разнообразных ручек, денег, кнопок и прочих предметов общественного пользования. Чаще всего последние «приживаются» и не могут проникнуть на слизистые дыхательной, пищеварительной или мочеполовой систем. Но и «собственная» микрофлора тоже может взбунтоваться и перейти в патогенную форму.
Определить характерную для вас микрофлору просто – достаточно помыть руки с мылом, а потом оставить глубокий «отпечаток» пальцев на питательной среде. Пару дней в инкубаторе – и белые или желтые полусферы расскажут микробиологу о ваших постоянных сожителях. Таким же образом проводит исследования и санитарно-эпидемиологическая служба, собирая отпечатки с дверей.
Проблема этого метода в том, что питательную среду приходится подбирать в зависимости от поисковой задачи: хотите найти клостридий – добавьте больше пептидов; чтобы найти уреолитиков, не обойтись без мочевины; а если нужно сразу понять, устойчивы ли эти штаммы к антибиотикам, то последние добавляют прямо в среду.
Шегре и соавторы публикации в Science изначально поставили перед собой другую задачу – описать разнообразие микробиотического мира, постоянно обитающего на нашей коже. Для этой цели старые, хотя и проверенные методы подходили не лучшим образом и ученые переключились на генетику.
С 20 точек на коже ученые смогли выделить и полностью секвенировать 112 283 рибосомальных РНК.
Поскольку рибосомы (органеллы, в которых синтезируются белки) бактерий отличаются от наших, то сомневаться в чистоте результатов не приходилось. Всего в исследовании приняли участие десять человек, которых не стали разделять по полу и расовым признакам, но с учетом того, что авторов у публикации 12 и все они работают в Бетесде, об источнике можно догадаться. Если это действительно так, то статью следовало назвать – «усредненный микробиологический портрет американского генетика».
Эти 20 точек ученые условно разделили на три группы, микрофлора которых, по мнению самих авторов, различается так же, как фауна джунглей и пустыни. Всего ученые обнаружили 205 видов, представляющих 19 родов.
Основу же составили четыре вида: Actinobacteria (51,8%), в лабораторных условиях используемые для получения антибиотиков; Firmicutes (24,4%), включающие и «полезные» молочнокислые бактерии, и патогенные клостридии, среди которых возбудитель столбняка; Proteobacteria (16,5%), к которым относятся возбудитель язвы желудка, менингита, гонореи и другие патогены; и, наконец, Bacteroidetes (6,3%), симбионты кожи и кишечника, часто становящиеся причиной оппортунистических инфекций, когда «нейтральные» или даже «полезные» микроорганизмы становятся патогенными при иммунодефицитах.
Неудивительно, что эти виды распространились по точкам тела в зависимости от своего рациона: например, сальные железы лица, скальпа, груди и спины обеспечивают питанием Propionibacterium acnes, которая при чрезмерном размножении вызывает одноименное заболевание.
Самым же представительным участком оказалась, как ни странно, не подмышка и даже не пах, а «сухая» ладонная сторона предплечья – здесь приютились аж 44 вида.
Самым негостеприимным участком – темная и скрытая от внешних воздействий поверхность кожи за ушами, всего 15 видов. Самой однородной, то есть заселенной близкими видами, оказалась подколенная ямка, самые неоднородные участки – спина, кожа за ушами и между пальцами ног.
На этом специалисты не остановились – повторив забор материала через полгода, они попробовали определить и изменчивость бактериального представительства. Здесь результат оказался вполне предсказуем – микробиота кожи достаточно постоянна. Однако изменчивость разных участков различается. Наиболее непостоянные, по вполне понятным причинам, – уже упоминавшееся предплечье, подколенная ямка и кожа признанных сухими ягодиц. По крайней мере 2 из 3 этих участков регулярно контактируют с источниками новой микрофлоры.
Сами авторы рассчитывают, что их работа станет «контрольной» группой при проведении исследований таких заболеваний как экзема, дерматит или псориаз. Даже несмотря на небольшую выборку и отсутствие поправки на такие факторы, как возраст, пол, род деятельности и рацион, им удалось обнаружить и немало сходных черт. Берегите свою индивидуальность – мойте её с мылом.
